2010年12月27日，哈尔滨工程大学与中国核工业集团公司签署战略合作协议。双方将强强联手，在人才培养、科学研究、学术交流、技术开发、成果转让、信息交换等方面加强合作。

根据协议，中核集团支持所属企事业单位在人才培养方面成为哈工程教学、科研、课程实习和社会实践的基地，设立奖学金。中核集团不定期为学校提供核工业最新发展动态和技术信息，进行全方位、多层面的技术交流。中核集团向哈工程开放相关研究课题，支持在核工程与技术领域开展基础性和应用性研究，支持所属单位与学校联合申报、参与科研。哈工程为中核集团承担学历教育和非学历教育任务。双方在毕业生就业、人才联合培养、加强学科建设等多方面进一步合作。学校以“订单＋联合”的培养方式，按一定的培养要求、培养期限、实习安排、培训课程、毕业设计、学员管理要求，培养中核集团所需人才。此前哈尔滨工程大学于2005年成立了中国高校首个核学院。