在黑龙江省委宣传部组织的学术期刊综合评估中，我校主办的期刊《哈尔滨工程大学学报》、《智能系统学报》凭借优良的学术质量和编辑出版水平双双获评优秀。自2015年该项综合评估开展以来，我校两刊实现“三连优”。

为推动学术期刊出版工作高质量发展，黑龙江省委宣传部按照单位自评、数据分析、管理部门赋分和评估结果反馈四个实施步骤，对我省出版的215种学术期刊开展学术期刊综合评估，其中优秀期刊11.6%，良好期刊60%，合格期刊26.5%，不合格期刊1.9%。

我校高度重视期刊发展工作，学校期刊社紧紧围绕学校发展目标，坚持贯彻新发展理念，以切实实现专家办刊为着力点，全面推进期刊高质量建设，出版质量逐年提升，学术影响不断扩大，精品期刊战略稳步推进。与此同时，不断加强期刊的国际化发展及传播能力建设，2020年在建资助项目5项，其中《哈尔滨工程大学学报（英文版）》入选中国科技期刊卓越行动计划，这一国家七部委联合开展的支持期刊着力提升传播能力和服务能力、引领学科发展、助力经济建设、培育科学文化的重要举措。